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12月17日,學(xué)術(shù)期刊《柳葉刀感染性疾病》雜志在線發(fā)表了中國(guó)科學(xué)院微生物研究所病原室研究員朱寶利課題組對(duì)多粘菌素耐藥基因mcr-1的比較基因組分析通訊文章。
11月18日,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)教授劉健華和中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)教授沈建忠領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì)在《柳葉刀感染性疾病》雜志發(fā)表文章,在動(dòng)物和住院患者中發(fā)現(xiàn)多粘菌素耐藥的新基因mcr-1。該基因由質(zhì)粒所攜帶,可以在不同菌株間進(jìn)行水平轉(zhuǎn)移。由于多粘菌素被認(rèn)為是對(duì)抗多重耐藥細(xì)菌的zui后一道防線;此前僅報(bào)道過(guò)由基因突變導(dǎo)致的多粘菌素耐藥,而這種耐藥性是不會(huì)在細(xì)菌間進(jìn)行傳播的。因此,質(zhì)粒攜帶的mcr-1基因一經(jīng)發(fā)現(xiàn),立即引起廣泛關(guān)注。文章報(bào)道,mcr-1基因主要存在于中國(guó),可能已傳播至東南亞國(guó)家。
微生物所副研究員胡永飛等在mcr-1基因序列公布的*時(shí)間,對(duì)其在目前所有已知的31000多個(gè)細(xì)菌基因組、4500多個(gè)元基因組、980萬(wàn)個(gè)人類腸道微生物基因(來(lái)自中國(guó)、美國(guó)和歐洲的1267個(gè)人體樣本)中的分布和序列的差異進(jìn)行了比較基因組分析。研究發(fā)現(xiàn)在368個(gè)已測(cè)序的中國(guó)人腸道樣品中,3個(gè)人腸道細(xì)菌中含有mcr-1基因的完整序列,24個(gè)人含有mcr-1基因片段。此外,mcr-1基因存在于一株葡萄牙2011年從食品中分離的沙門氏菌中。這些結(jié)果表明mcr-1基因已經(jīng)傳播到中國(guó)健康人的腸道細(xì)菌中,并且早在2011年或之前已經(jīng)在歐洲出現(xiàn)。比較基因組分析發(fā)現(xiàn),mcr-1基因在不同菌株中處于不同的遺傳背景中;表明除了質(zhì)粒之外,很可能mcr-1基因本身連同其上游序列可以單獨(dú)被其它可移動(dòng)遺傳元件所捕獲并進(jìn)行傳播(如圖)。
此外,文章特別強(qiáng)調(diào)由于mcr-1基因在雞、豬等屠宰動(dòng)物及零售肉類中被發(fā)現(xiàn),該研究進(jìn)一步證實(shí)其存在于健康人體腸道細(xì)菌中,這些數(shù)據(jù)強(qiáng)烈提示mcr-1基因可能通過(guò)食物鏈進(jìn)行傳播,范圍應(yīng)該即刻予以關(guān)注。(《柳葉刀感染性疾病》雜志在該研究發(fā)表的同時(shí),報(bào)道了mcr-1基因已在泰國(guó)、老撾、法國(guó)、荷蘭及阿爾及利亞發(fā)現(xiàn))。
胡永飛為該文章*作者,朱寶利為通訊作者。研究得到了國(guó)家“973”計(jì)劃項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目及中國(guó)科學(xué)院青年創(chuàng)新促進(jìn)會(huì)的資助。
比較基因組分析含有mcr-1基因的序列
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