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生命中心伊成器課題組與湯富酬課題組合作在《Cell Stem Cell》雜志上發(fā)表了題為“Single-Cell 5-Formylcytosine Landscapes of Mammalian Early Embryos and ESCs at Single-Base Resolution”的研究論文，在上實(shí)現(xiàn)了單細(xì)胞水平的 5 - 醛基胞嘧啶全基因組測序，并解析了小鼠著床前胚胎中的單堿基分辨率 5 - 醛基胞嘧啶（5fC）譜圖。

哺乳動物早期胚胎發(fā)育過程中會發(fā)生劇烈的表觀遺傳重編程。在 5 - 甲基胞嘧啶的主動去甲基化過程中會產(chǎn)生一種新穎的表觀遺傳學(xué)修飾 5fC。伊成器課題組與湯富酬課題組緊密合作，開發(fā)了一種基于特異性化學(xué)標(biāo)記的單細(xì)胞、單堿基分辨率的 5fC 測序技術(shù)（CLEVER-seq），并將其應(yīng)用于小鼠著床前胚胎以及哺乳動物多能干細(xì)胞的 5fC 檢測。研究發(fā)現(xiàn)，在小鼠早期胚胎發(fā)育過程中，5fC 發(fā)生高度動態(tài)變化并富集在基因表達(dá)調(diào)控區(qū)域。5fC 在不同的胚胎發(fā)育階段以及多能干細(xì)胞中具有高度的異質(zhì)性。同時，啟動子區(qū)域 5fC 的產(chǎn)生先于相應(yīng)基因的表達(dá)，說明在哺乳動物早期胚胎發(fā)育過程中主動去甲基化可能參與了關(guān)鍵基因的表達(dá)調(diào)控。北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院博士生朱晨旭、高云、郭紅山博士以及夏波為該論文的并列*作者；生命中心伊成器研究員、湯富酬研究員為該論文的共同通訊作者。

該項(xiàng)研究得到了國家自然科學(xué)基金、科技部 973 計劃、北大清華生命科學(xué)聯(lián)合中心、北京未來基因診斷高精尖創(chuàng)新中心的資助。

小鼠早期胚胎發(fā)育過程中 5fC 位于重要功能區(qū)域并與基因表達(dá)激活密切關(guān)聯(lián)