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病菌被吞噬細胞吞噬后，其結果根據病菌類型、毒力和人體免疫力不同而不同?；撔郧蚓煌淌珊?，一般經5—10分鐘死亡，30—60分鐘被破壞，這是*吞噬。而結核分枝桿菌、布魯氏菌、傷寒沙門氏菌、軍團菌等，則是已經適應在宿主細胞內寄居的胞內菌。
在無特異性免疫力的人體中，它們雖然也可以被吞噬細胞吞入，但不被殺死，這是不*吞噬。不*吞噬可使這些病菌在吞噬細胞內得到保護，免受機體體液中特異性抗體、非特異性抗菌物質或抗菌藥物的有害作用；有的病菌尚能在吞噬細胞內生長繁殖，反使吞噬細胞死亡；有的可隨游走的吞噬細胞經淋巴液或血流擴散到人體其它部位，造成廣泛病變。
此外，吞噬細胞在吞噬過程中，溶酶體釋放出的多種水解酶也能破壞鄰近的正常組織細胞，造成對人體不利的免疫病理性損傷。
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