在現(xiàn)有的5000種哺乳動(dòng)物中，有超過(guò)100種已經(jīng)進(jìn)行了基因組測(cè)序，但是，只有9種爬行動(dòng)物（在10000個(gè)物種當(dāng)中）的基因組對(duì)科學(xué)界來(lái)說(shuō)是可用的。zui近，瑞士日內(nèi)瓦大學(xué)（UNIGE）的一個(gè)研究小組，構(gòu)建了一個(gè)大的數(shù)據(jù)庫(kù)，其中就包括一種爬行動(dòng)物——玉米蛇的新基因組測(cè)序，這種蛇越來(lái)越多地被用來(lái)了解爬行動(dòng)物的進(jìn)化。。

基因組學(xué)可以讓我們更好地探討生命世界的演化。事實(shí)上，描述每一個(gè)基因的功能，可讓我們能夠了解蛇如何失去肢體，或者各種皮膚色彩如何演變。不幸的是，爬行動(dòng)物很少出現(xiàn)在基因組大數(shù)據(jù)庫(kù)中。鑒于此，研究人員構(gòu)建了一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)，包括來(lái)自主要爬行動(dòng)物演化譜系的基因組序列，該數(shù)據(jù)庫(kù)稱(chēng)為Reptilian Transcriptomes Database 2.0。 研究人員們的目標(biāo)是，通過(guò)對(duì)來(lái)自幾個(gè)爬行動(dòng)物物種的所有基因進(jìn)行測(cè)序，產(chǎn)生很大一部分的缺失數(shù)據(jù)。為了達(dá)到這個(gè)目標(biāo)，我們使用表達(dá)zui大數(shù)目基因的組織，如大腦和腎臟。其他多個(gè)研究團(tuán)隊(duì)也產(chǎn)生了測(cè)序數(shù)據(jù)，但每一個(gè)研究小都用不同的方法進(jìn)行數(shù)據(jù)分析，從而使爬行動(dòng)物基因組進(jìn)化的研究變得非常困難。因此，研究人員工作的另一部分，是收集這些數(shù)據(jù)并開(kāi)發(fā)一種生物信息學(xué)方法，來(lái)產(chǎn)生一個(gè)統(tǒng)一的數(shù)據(jù)庫(kù)，可讓研究人員自由訪(fǎng)問(wèn)和定期更新。這一工具對(duì)于世界各地致力于脊椎動(dòng)物（特別是爬行動(dòng)物）發(fā)育和進(jìn)化的研究人員，將是非常有用的。

玉米蛇，一種新的模式生物

基因組測(cè)序是一項(xiàng)巨大的任務(wù)。它需要確定被研究動(dòng)物的全基因組序列，對(duì)應(yīng)于玉米蛇的20億個(gè)核苷酸。DNA包含四個(gè)基本的分子（核苷酸）——ACGT，通過(guò)配對(duì)組裝（A與T，C與G），并構(gòu)成了每個(gè)基因的序列。要分析基因組，研究人員必須讀取100到250個(gè)核苷酸的DNA短片段，然后再組裝以重建形成每個(gè)染色體的巨大鏈。

如今，科學(xué)家們可以進(jìn)行這樣的組裝，建立約一百萬(wàn)個(gè)核苷酸的片段。研究人員們的目的是要獲得一個(gè)人們可以依賴(lài)的真正的爬行動(dòng)物基因組模型。在這里，我們覆蓋了蛇全基因組大小的大約85%。還有很多額外的工作要做，因?yàn)椋瑸榱双@得與人類(lèi)基因組質(zhì)量相似的測(cè)序，我們需要組裝的染色體，可能形成2億多個(gè)核苷酸。對(duì)于研究爬行動(dòng)物的發(fā)育和進(jìn)化來(lái)說(shuō)，玉米蛇是非常的，因?yàn)樗苋菀追庇锹焉模⑶沂菬o(wú)毒的。本物種也可用于研究遺傳決定論和皮膚顏色的演化，對(duì)于那些以自然棲息地作為偽裝的動(dòng)物，這尤為重要。研究人員很高興地宣布，玉米蛇也是有限的模型物種組中的一個(gè)成員，可允許研究人員更好地了解造成物種進(jìn)化多樣性和復(fù)雜性的生物和物理機(jī)制。