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江蘇晶美生物科技有限公司

蛇失去四肢的遺傳學秘密

時間:2016-11-25閱讀:239
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    蛇在1億年前失去了它們的四肢,但科學家們一直未弄清相關的遺傳學變化。10月20日發表的一項研究,對這一過程進行了闡述,描述了一段蛇四肢形成相關的DNA片段,在蛇當中是突變的。當研究人員把蛇的這段DNA插入到小鼠體內時,小鼠發育出了截短的四肢,這表明在蛇的進化過程中,一段關鍵的DNA片段,失去了其支持肢體生長的能力。

    實際上,這是人類以及所有其他有腿脊椎動物形成肢體所需的DNA指令的許多組成部分當中的一個。在蛇當中,它出了問題。它可能是發生在蛇身上的幾個進化步驟中的一個,不同于大多數的哺乳動物和爬行動物,蛇不能形成四肢。

今天的蛇都經歷了脊椎動物進化中一個zui戲劇性的體型變化。為了研究這種適應性的分子根源,研究人員們著手研究已發布的蛇基因組,包括基礎的蛇,如蟒蛇和巨蟒的基因組,它們有殘腿——小腿骨埋在它們的肌肉中;和的蛇,如蛇和眼鏡蛇,它已經失去了所有的肢體結構。在這些基因組中,他們專門集中在一個叫Sonic hedgehog(Shh)的基因,該基因參與多種發育過程——包括肢體的形成。研究人員深入分析了Shh基因的一個調控因子,稱為ZRS的一段DNA序列,該基因存在于蛇當中但發生了變異。

    為了確定這些基因突變的后果,研究人員利用基因組編輯方法CRISPR,將來自其他各種脊椎動物的ZRS插入小鼠體內,替代小鼠的調節因子。當插入來自其他哺乳動物(如人類)的ZRS時,小鼠四肢發育正常。甚至當他們插入來自魚的ZRS時——它們的鰭的結構與四肢很不相同,小鼠也發育出了正常四肢。然而,當研究人員用Python或眼鏡蛇的ZRS替代小鼠的ZRS時,小鼠發育出了嚴重截斷的前肢和后肢。

    使用這些新的基因組工具,我們就可以開始探索同一增強子的不同進化版本,是如何影響肢體發育的,并看看到底發生了什么。我們過去主要是盯著序列和推測分子進化,但現在,我們可以把這些研究上升到一個更高層次。

為了確定在蛇進化過程中負責其失活的ZRS突變,研究人員仔細觀察了單個序列變化的進化史。通過比較蛇和其他脊椎動物的基因組,他們發現了一個特別可疑的17堿基對的缺失,它只發生在蛇當中;這段缺失刪除了一段ZRS,其對于調節有腳動物的Shh基因發揮關鍵作用。

研究小組調節了進化鐘,在一個人造的蟒蛇ZRS的混合版本中,恢復了缺失的17個堿基對,并在小鼠中檢測了編輯的DNA。那些在基因組中攜帶這種進化“復活”ZRS的小鼠——取代了它們正常的調節因子,發育出了正常的腿。然而,進化事件可能比僅僅一個缺失更為復雜:有可能一些冗余存在于小鼠ZRS中。蛇ZRS的其他幾個突變,可能也對于其進化過程中呼吸功能的喪失,發揮作用。

    當然,蛇不是*缺乏四肢的脊椎動物——一些蜥蜴、鰻魚和其他魚類以及海洋哺乳動物,也適應了不同程度的肢體減少,并可能經歷了一個稍微不同的進化過程。在動物的進化過程中,失去四肢已經獨立發生過多次,我們可以安全的假設,這與影響其他基因的突變有關。這是一個復雜的問題,但隨著基因組編輯工具的引入,我們終于可以將特定的DNA變化與身體形態的改變起來。

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