如果噬菌體篩選的過程在微孔板中進行，靶標蛋白固定的基本條件也就建立起來了。通過預先包被親和素（avidin）或者抗標簽的抗體之類的試劑，把靶標蛋白間接地固定到包被過的微孔板上，這樣固定方法對于噬菌粒結合性檢測是有益的。盡管如此，由于噬菌粒結合性檢測中使用溶液相的靶標作為結合的競爭劑來生成結合性曲線，所以不應該通過使用抗靶標的抗體來進行固定。下面我們給出一個把靶標蛋白直接固定到微孔板上的典型實驗方案。
靶標包被的微孔板的準備
[器材和試劑]
● 9孔板（Nunc Maxisorp）
● 50mmol/L的碳酸鈉緩沖液，pH 9．4
● 醋酸酯平板蓋（Acetateplatesealer；Dynex）
● PBST：含0．05％Tween-20（體積分數）的磷酸鹽緩沖液，pH 7．4
● CBB：酪蛋白封閉緩沖液（Pierce）
● 8通道P200型多通道移液槍
● 自動洗板儀（Skatron或類似產品）
[方法]
1．將溶于碳酸鈉溶液（預先確定的濃度見實驗方案5．2）的靶標蛋白加入96孔板的底部， 每孔100u1。在無靶標的對照孔中，只加入lOOul碳酸鈉溶液。
2．微孔板蓋好，小心地將微孔板放入4℃冰箱中，不要擾動包被液，孵育過夜。
3．將微孔板內溶液甩出，然后將微孔板倒扣在吸水紙上，吸干殘留液體。
4．在所有孔中馬上加入CBB（不加去垢劑）進行封閉，每孔230ul，在室溫下反應30 分鐘。
5．在將要使用微孔板時，吸去微孔板內溶液，用PBST將微孔板洗滌三次。
在進行噬菌體結合性檢測前，用來包被的靶標蛋白的濃度，以及在競爭性結合實驗中加入的噬菌體的濃度，都必須事*行測定。兩個過程zui初都可以利用保存的野生型噬菌體，在一個二維方格（two—dimensional grid）中同時進行。
