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上海科興利用新技術構造新型蛋白質相互作用圖譜
點擊次數：635 發布時間：2011-9-15
據報道，近期來自上海科興商貿有限公司在蛋白質相互作用研究中取得突破性進展。這一研究成果，上海佳倫生物科技有限公司做出相關的解析，為人們解答這一困惑和不解，從而十分給力。
生命系統復雜性zui重要的特征不僅在于其組成成分的復雜性，更在于各組成成分之間的關系，而在所有的這些關系中，蛋白質之間的相互作用在形成幾乎所有生命系統、調控各種生理/病理進程中發揮至關重要的作用。蛋白質相互作用不僅為研究未知蛋-白質的生物學功能提供了線索，也為充分了解一個細胞或一個生物途徑的生物學機制，提供了必要的信息。
近年來科學家們發展了許多高通量的實驗方法，并以此發現、建立了越來越多的蛋白質相互作用網絡。但是，現有的蛋白質相互作用網絡只能反映蛋白質之間存在連接關系，而真實生命體系中大部分的蛋白質相互作用具有信號轉導、轉錄激活/抑制等明顯的信號流方向性。
為了證明這一切，弄清所有的迷惑，因此上海佳倫生物科技有限公司的相關工作人員利用功能基因組及蛋白質組技術結合生物信息學方法成功構建了一個新型的定向蛋白質相互作用圖譜，這對于解析細胞內蛋白質間相互關系以及相關信號傳導機制具有極其重要的意義。
在這篇文章中，研究人員首先分析獲得了來自京都基因與基因組百科全書（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes ，KEGG）的473個人類全長開放閱讀框（ORFs），然后利用酵母雙雜交技術對這些ORF進行了檢測，從而構建了一個基于Y2H的PPI蛋白質互作網絡圖譜，其中包含了2626種相互作用，涉及到1126個人類蛋白。為了獲得更廣泛準確的分析數據，研究人員利用來自公共資源的PPI數據進一步對Y2H PPI蛋白質互作網絡進行了擴展。基于樸素貝葉斯分類算法（naïve Bayesian classifier.）研究人員將來自10組實驗數據的蛋白質相互作用與Y2H PPI圖譜數據進行綜合分析后成功構建出了*個定向人類蛋白質相互作用 （HPPI2）網絡圖譜，其中涵蓋了6339個蛋白，32,706種相互作用。
這些研究數據為科學家們提供了蛋白互作的雙重數據，這些數據，以及將來的蛋白互作組圖譜將組成一個信息庫。
上海科興是一家技術服務型渠道企業,在行業發展中所承擔的角色是一種溝通產出方和需求方（科研和市場）的媒介，我們致力為行業人才提供了包括科研在內的更多出口，為科研提供了有力的硬件支持，有效地促進科研和市場需求結合，提高了科研成果的轉化效率，使得科研更具活力。目前國家對于生物行業的發展給予了極大的重視，但更多地側重于科研的投入，行業內缺乏*的技術服務體系和渠道支撐...
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