來(lái)自四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物遺傳育種研究所，美國(guó)休斯頓大學(xué)，LC Sciences公司等處的研究人員發(fā)表了題為“Repertoire of Porcine MicroRNAs in Adult Ovary and Testis by Deep Sequencing”的文章，深入研究了microRNA在豬成熟卵巢和睪丸中的表達(dá)圖譜。這一研究成果公布在International Journal of Biological Sciences雜志上。

文章的通訊作者是四川農(nóng)業(yè)大學(xué)李學(xué)偉教授，以及美國(guó)LC Sciences公司科學(xué)家，休斯頓大學(xué)高曉蓮教授，其中李學(xué)偉教授早年畢業(yè)于四川農(nóng)學(xué)院（現(xiàn)四川農(nóng)業(yè)大學(xué)），現(xiàn)任四川農(nóng)業(yè)大學(xué)博士生導(dǎo)師、四川省學(xué)術(shù)和技術(shù)帶頭人，國(guó)家“千百萬(wàn)人才工程”百千層次人才，四川省跨世紀(jì)青年科技學(xué)術(shù)帶頭人，享受*特殊津貼。文章*作者是李明洲博士。

microRNA（miRNA）是一大類短小的內(nèi)源性RNA，已知它們可以在轉(zhuǎn)錄后水平上抑制基因表達(dá)，并參與了幾乎所有的細(xì)胞生理過(guò)程。miRNA表達(dá)水平的變化與許多疾病密切相關(guān)。卵巢卵泡發(fā)育與睪丸生精功能是復(fù)雜而又協(xié)調(diào)的生理過(guò)程，其中大量基因的嚴(yán)密調(diào)節(jié)表達(dá)和相互作用可能會(huì)受到這些miRNA的調(diào)控。識(shí)別和初步表征生殖腺特異表達(dá)的miRNA將是透徹了解由miRNA介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄后基因調(diào)控在哺乳動(dòng)物生殖過(guò)程中所起作用的先決條件。

在這篇文章中，研究人員利用深度測(cè)序技術(shù)（Solexa測(cè)序），對(duì)成熟卵巢和睪丸內(nèi)的豬miRNA表達(dá)譜進(jìn)行了鑒定，并利用專門開發(fā)的生物信息學(xué)分析管道對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行了深入分析。將可信的成熟miRNA同其它種類的小分子RNA進(jìn)行了區(qū)分。通過(guò)這種方法，研究人員共檢測(cè)到582條前體發(fā)夾序列（miRNA前體），編碼732條成熟miRNA，其中673條為單一序列。統(tǒng)計(jì)學(xué)分析顯示，224條miRNA（占673條的33.28%）在卵巢和睪丸文庫(kù)之間存在顯著差異表達(dá)（P < 0.001）。大多數(shù)位于X染色體（伴X染色體miRNA）的差異表達(dá)miRNA（34條中的24條，占70.59%）在卵巢中的表達(dá)較睪丸中顯著上調(diào)（P < 0.001）。可以預(yù)見，伴X染色體miRNA為睪丸優(yōu)先表達(dá)或睪丸特異性表達(dá)模式。

為了探究伴X染色體miRNA在基因組定位簇之間共表達(dá)的可能性，研究人員采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR（q-PCR）技術(shù)，考察了在7種常見豬組織中miRNA位點(diǎn)的間隔距離與32個(gè)高置信度伴X染色體miRNA共表達(dá)模式之間的關(guān)系。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示，鄰近的miRNA對(duì)常會(huì)共同表達(dá)，暗示50kb基因組距離內(nèi)的miRNA通常來(lái)源于共同的轉(zhuǎn)錄本。

此項(xiàng)研究以伴X染色體miRNA的共表達(dá)模式為研究重點(diǎn)，研究了成年豬生殖腺的miRNA轉(zhuǎn)錄組特征。該研究成果將會(huì)促進(jìn)有關(guān)miRNA在器官特異性的生殖過(guò)程所扮演角色的研究。　

來(lái)源：生物通