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TRIzol法同時提取DNA、RNA和蛋白質

時間:2016/7/4閱讀:1032
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TRIzol試劑適用于從細胞和組織中快速分離RNA。TRIzol試劑有多組分分離作用,與其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、鹽酸胍法、硫氰酸胍法等相比,zui大特點是可同時分離一個樣品的RNA\DNA\蛋白質.TRIzol使樣品勻漿化,細胞裂解,溶解細胞內含物,同時因含有RNase 抑制劑可保持RNA的完整性。在加入氯仿離心后,溶液分為水相和有機相,RNA在水相中。取出水相用異丙醇沉淀可回收RNA;用乙醇沉淀中間層可回收 DNA;用異丙醇沉淀有機相可回收蛋白質。
TRIzol試劑可用于小量樣品(50~100mg組織、5×106細胞)也適用于大量樣品(≥1g組織、>107細胞)。對人,動物,植物組織,細菌均適用,可同時處理大量不同樣品,整個提取過程在一小時內即可完成。分離的總RNA無蛋白質和DNA污染,可用于 Northern Blot,dot blot,ployA篩選,體外翻譯,RNase保護分析和分子克隆。在用于RT-PCR時如果兩條引物存在于一個單一外顯子內,建議用無RNase的 DNaseⅠ處理RNA樣品,避免出現假陽性。共純化的DNA可用作標準,比較不同樣品RNA的得率,也可用于PCR和酶切。蛋白質可用于Western Blotting。 
規格:100ml 黃色透明液體
儲存條件:2~8℃避光保存12個月
注意:請勿直接接觸皮膚或吞咽,以免灼傷。如接觸皮膚應立即用洗滌劑和大量水沖洗。忌用乙醇擦洗,乙醇會加重灼傷程度。 
預防RNase污染注意事項: 
1.經常更換新手套,皮膚上常帶有的細菌,霉菌可能成為RNase的來源。 
2.使用滅過菌的RNA塑料制品避免交叉污染。 
3.RNA在TRIzol試劑中時不會被RNase污染,但提取后繼續處理過程中應使用不含RNase的塑料和玻璃器皿。玻璃器皿可在150℃烘烤4小時,塑料制品可在0.5M NaOH中浸泡10分鐘,然后用水*清洗,高壓滅菌,即可去除RNase。 
4.配制溶液應使用無RNase的水(將水加入處理過不含RNase的玻璃瓶中,加入DEPC至終濃度0.01℅v/v,放置過夜,高壓滅菌
注:DEPC有致癌之嫌,需小心操作)。
1、RNA的提取
準備試劑:氯仿,異丙醇,75℅乙醇,無RNase的水或0.5℅SDS(溶液均需用DEPC處理過的水配制)。
操作步驟
1. 勻漿處理:
a.組織將組織在液氮中磨碎,每50~100mg組織加入1ml TRIzol,用勻漿儀進行勻漿處理。樣品體積不應超過TRIzol體積10℅。 
b.單層培養細胞 直接在培養板中加入TRIzol裂解細胞,每10cm2面積(即3.5cm直徑的培養板)加1ml,用移液器吸打幾次。TRIzol的用量應根據培養板面積而定,不取決于細胞數。TRIzol加量不足可能導致提取的RNA有DNA污染。 
c.細胞懸液離心收集細胞,每5~10×106動物、植物、酵母細胞或1×107細菌細胞加入1mlTRIzol,反復吸打。加TRIzol之前不要洗滌細胞以免mRNA降解。一些酵母和細菌細胞需用勻漿儀處理。
2.將勻漿樣品在室溫(15~30℃)放置5分鐘,使核酸蛋白復合物*分離。
3.可選步驟:如樣品中含有較多蛋白質,脂肪,多糖或胞外物質(肌肉,植物結節部分等)可于2~8℃10000×g離心10分鐘,取上清。離心得到的沉淀中包括細胞外膜,多糖,高分子量DNA,上清中含有RNA。處理脂肪組織時,上層有大量油脂應去除。取澄清的勻漿液進行下一步操作。
4. 每使用1ml TRIzol加入0.2ml氯仿,劇烈振蕩15秒,室溫放置3分鐘。
5. 2-8℃10000×g離心15分鐘。樣品分為三層:底層為黃色有機相,上層為無色水相和一個中間層。RNA主要在水相中,水相體積約為所用TRIzol 試劑的60℅。
6. 把水相轉移到新管中,如要分離DNA和蛋白質可保留有機相,進一步操作見后。用異丙醇沉淀水相中的RNA。每使用1mlTRIzol加入0.5ml異丙醇,室溫放置10分鐘。
7. 2~8℃10000×g離心10分鐘,離心前看不出RNA沉淀,離心后在管側和管底出現膠狀沉淀。移去上清。
8. 用75℅乙醇洗滌RNA沉淀。每使用1ml TRIzol至少加1ml 75℅乙醇。2~8℃不超過7500×g離心5分鐘,棄上清。
9.室溫放置干燥或真空抽干RNA沉淀,大約晾5~10分鐘即可.不要真空離心干燥,過于干燥會導致RNA的溶解性大大降低。加入25~200μl 無RNase的水或0.5℅SDS,用槍頭吸打幾次,55~60℃放置10分鐘使RNA溶解。如RNA用于酶切反應,勿使用SDS溶液。RNA也可用 100℅的去離子甲酰胺溶解,-70℃保存。
注意事項: 
1.從少量樣品(1~10mg組織或102~104細胞)中提取RNA時可加入少許糖原以促進RNA沉淀。例如加800mlTRIzol勻漿樣品,沉淀RNA前加5~10μgRNase-free糖原。糖原會與RNA一同沉淀出來,糖原濃度不高于4mg/ml是不影響*鏈的合成,也不影響PCR反應。 
2.勻漿后加氯仿之前樣品可以在-60至 -70℃保存至少一個月。RNA沉淀可以保存于75% 酒精中2~8℃一星期以上或-5至-20℃一年以上。 
3.分層和RNA沉淀時也可使用臺式離心機,2600×g離心30~60分鐘。
預期產量:1mg組織或1×106細胞提取RNA分別為: 
肝和脾 6~10μg ,腎3~4μg ,骨骼肌和腦組織1~1.5μg ,胎盤1~4μg ,上皮細胞8~15μg ,成纖維細胞5~7μg 。
常見問題分析:
得率低:
A.樣品裂解或勻漿處理不*。
B.RNA沉淀未*溶解。
A260/A280<1.65 :
A.檢測吸光度時,RNA樣品沒有溶于水,而溶于了TE中。低離子濃度和低pH值條件下 A280值偏高。
B.樣品勻漿時加的試劑量太少。
C.勻漿樣品時未在室溫放置5分鐘。
D.吸取水相時混入了有機相。
E.RNA沉淀未*溶解。
2、RNA降解:
A.組織取出后沒有馬上處理或冷凍。
B.待提取RNA的樣品沒有保存于-60至-70℃,而保存在了-5至 -20℃。
C.細胞在用胰酶處理時過度。
D.溶液或離心管未經RNase去除處理。
E.電泳時使用的甲醛pH值低于了3.5 。
DNA污染: 
A. 樣品勻漿時加的試劑量太少。
B.樣品中含有有機溶劑(如乙醇,DMSO等),強緩沖液或堿性溶液。
蛋白聚糖和多糖污染:
沉淀RNA的過程中作以下改進可去除這些污染,步驟7中,每使用1ml TRIzol在水相中加0.25ml異丙醇和0.25ml高鹽溶液(0.8M檸檬酸鈉和1.2MNaCl)混合離心,按之前操作進行。這種方法可使蛋白聚糖和多糖留在溶液中,沉淀出純 RNA。從含有大量多糖的植物中提取RNA時應在勻漿后離心,并加上以上操作步驟。
DNA的分離
準備試劑:乙醇0.1M檸檬酸鈉(含10%乙醇) 75%乙醇8mM NaOH
操作步驟:
1. 樣品加氯仿分層后,移去上層水相,用乙醇沉淀中間層和有機相中的DNA。每使用1mlTRIzol加0.3ml無水乙醇混勻,室溫放置3分鐘,2~8℃不超過2000×g離心5分鐘。 
2. 移去上清,(如需分離蛋白質,可保留,進一步操作見后)用含10%乙醇的0.1M檸檬酸鈉洗滌DNA沉淀。每用1mlTRIzol加入1ml檸檬酸鈉,室溫放置30分鐘,2~8℃2000×g離心5分鐘,棄上清,重復一次。 
3. 用75%乙醇再洗一遍DNA沉淀,每用1ml TRIzol加入1.5~2 ml75%乙醇,室溫放置10~20分鐘(不時顛倒混合)2~8℃2000×g離心5分鐘, 棄上清。 
4. 室溫放置晾干DNA 5~15分鐘,用8mM NaOH溶解DNA。從50~70mg組織或107細胞中分離的DNA溶于300~600μl 8mM NaOH,DNA的濃度通常為0.2~0.3μg/μl。提取的DNA沉淀不易溶于水和Tris緩沖液中,建議用弱堿溶解,8mMNaOH的pH值為9,溶解DNA后可用TE,HEPES調節pH。從某些樣品(尤其是組織)中提取的DNA中可能包含一些膠狀不溶物可>12000×g離心10分鐘除去。
DNA的定量:取一份溶于8mMNaOH的DNA加水測A260值。一單位A260值相當于50μg/ml雙鏈 DNA。根據DNA產量可估計細胞數,人、大鼠、小鼠1×106二倍體細胞含DNA的量分別為 7.1μg,6.5μg,5.8μg。
預期產量:1mg組織或1×106細胞提取DNA分別為肝和腎3~4μg 骨骼肌,腦組織,胎盤2~3μg 人,大鼠,小鼠培養細胞(1×106)5~7μg 成纖維細胞5~7μg。
應用:
1.用于PCR 溶于8mM NaOH的DNA用0.1M HEPES調pH至8.4,取0.1~1μg DNA用作模板。 
2.酶切反應用HEPES或1mM EDTA調節pH至適當值。每μg DNA使用3~5單位的酶,80~90%的DNA是可消化的。 
1ml 8mM NaOH溶解的DNA樣品pH值調節
Final pH 0.1M HEPES(μl) Final pH 1M HEPES(μl) 
8.4 86 7.2 23 
8.2 93 7.0 32 
8.0 101 
7.8 117 
7.5 159
注意事項: 
1. DNA在中間層和有機相中時可在2~8℃保存過夜。 
2.DNA沉淀在75%乙醇中2~8℃可保存幾個月。 
3.DNA在8mM NaOH溶液中4℃可放置過夜,如長期保存需用HEPES調節pH至7~8并且加EDTA至1mM,可置于4℃或-20℃長期保存。
常見問題分析:
得率低:
A.樣品勻漿和裂解的不*。
B.zui終得到的DNA沉淀沒有*溶解。
A260/A280<1.70 :
A. 檢測吸光度時,RNA樣品沒有溶于水,而溶于了TE中。
B.酚除去的不*,可用0.1M檸檬酸鈉(含10%乙醇)再洗一遍DNA沉淀。
DNA降解:
A.組織取出后沒有馬上處理或冷凍。
B.待提取RNA的樣品沒有保存于-60至-70℃,而保存在了-5至 -20℃。
C.樣品勻漿時使用了高速勻漿儀。
RNA污染:
A.氯仿分層后水相去除的不干凈。
B.DNA沉淀用0.1M檸檬酸鈉(含10%乙醇)洗的不*。
3、蛋白質的提取
準備試劑:異丙醇含0.3M鹽酸胍的95%乙醇無水乙醇1%SDS。
操作步驟:
1.取沉淀DNA后剩余的上清,用異丙醇沉淀蛋白質。每使用1ml TRIzol加1.5ml異丙醇,室溫放置10分鐘,2~8℃12000×g離心10分鐘棄上清。
2.用含0.3M鹽酸胍的95%乙醇洗滌蛋白質沉淀。每使用1mlTRIzol加2ml洗滌液,室溫放置20分鐘,2~8℃7500×g離心5分鐘,棄上清,重復兩次。用2ml無水乙醇同樣方法再洗一次。
3.真空抽干蛋白質沉淀5~10分鐘,用1%SDS溶解蛋白質,反復吸打,50℃溫浴使其*溶解,不溶物2~8℃10000×g離心10分鐘除去。分離得到的蛋白質樣品可用于Western Blot或-5至-20℃保存備用。
注意事項: 
1.蛋白質沉淀可保存在含0.3M鹽酸胍的95%乙醇或無水乙醇中2~8℃一個月以上或-5至-20℃一年以上。 
2.用0.1% SDS在2~8℃透析三次,10000×g離心10分鐘取上清即可用于Western Blot。
常見問題分析:
得率低:
A.樣品裂解或勻漿處理不*。
B.zui后得到的蛋白質沉淀未*溶解。
蛋白質降解:組織取出后沒有馬上處理或冷凍。
電泳時條帶變形:蛋白質沉淀洗滌不充分。

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