在過去的幾年里，長非編碼RNAs（lncRNAs）已經(jīng)得以廣泛研究。有研究已在小鼠、大鼠和人類中鑒定了大量的lncRNAs，其中一些已被證明在肌肉發(fā)育和生成過程中起著重要的作用。然而，對(duì)于覆蓋家畜骨骼肌所有發(fā)育階段的lncRNAs的特性，報(bào)道還較少。

8月22日，四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院的研究人員在《BMC Genomics》發(fā)表題為“Genome-wide identification and characterization of long non-coding RNAs in developmental skeletal muscle of fetal goat”的研究成果。這項(xiàng)研究提供了一份山羊肌肉相關(guān)lncRNA的目錄，將有助于我們更全面地了解哺乳動(dòng)物肌肉發(fā)育的根本分子機(jī)制。四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院的張紅平教授和李利教授，是本文共同通訊作者。

全基因組轉(zhuǎn)錄研究表明，真核基因組的大型區(qū)域被轉(zhuǎn)錄為一個(gè)異質(zhì)化的非編碼RNAs（ncRNAs）群。一般來說，小于200個(gè)核苷酸的ncRNA通常被描述為小RNA，例如，microRNA（miRNA）、Piwi互動(dòng)RNAs（piRNAs）、小干擾RNAs（siRNAs），和經(jīng)典的ncRNA，如核糖體RNAs（rRNA）、轉(zhuǎn)移RNAs（tRNA）和小nucleolar RNAs（snoRNAs）；大于200個(gè)核苷酸的ncRNA被描述為長非編碼RNA（lncRNA）。在過去的幾年中，越來越多的lncRNAs在哺乳動(dòng)物中已被發(fā)現(xiàn)，包括智人、小鼠、牛、豬和綿羊。并據(jù)此推出，lncRNA在生物過程（如轉(zhuǎn)錄調(diào)控）、表觀遺傳修飾、發(fā)育、細(xì)胞分化以及一些疾病中，發(fā)揮關(guān)鍵的作用。

作為重要的經(jīng)濟(jì)動(dòng)物，家養(yǎng)山羊（Capra hircus）主要用于肉食的生產(chǎn)。因此，揭示骨骼肌形成和發(fā)育的分子機(jī)制，是至關(guān)重要的。肌肉的發(fā)育是一個(gè)復(fù)雜的過程，需要多因素的協(xié)同表達(dá)和相互作用。zui近的一些研究表明，lncRNA在成肌分化和肌肉生成過程中起著至關(guān)重要的作用。然而，目前探索哺乳動(dòng)物骨骼肌生長發(fā)育分子機(jī)制的大多數(shù)策略是，通過高通量測序技術(shù)檢測編碼基因的表達(dá)和功能，如MRF（生肌調(diào)節(jié)因子）、MEF2（肌細(xì)胞增強(qiáng)因子-2）家族和配對(duì)盒蛋白，這些策略也應(yīng)用于山羊miRNA和mRNA表達(dá)譜的分析。因此，關(guān)于骨骼肌發(fā)育相關(guān)lncRNAs的信息，仍然是有限的，特別是山羊中。

在這項(xiàng)研究中，研究人員使用Illumina HiSeq 2500平臺(tái)，系統(tǒng)地鑒定和表征了山羊胚胎和產(chǎn)后山羊骨骼肌中的lncRNAs。總共確定了3981個(gè)lncRNA轉(zhuǎn)錄本，其中577個(gè)在不同發(fā)育階段的骨骼肌RNA文庫之間的成對(duì)比較中，是顯著差異表達(dá)的。據(jù)我們所知，目前還沒有對(duì)山羊肌肉lncRNA及其生物學(xué)功能的相關(guān)報(bào)道。因此，這些研究結(jié)果將為我們更好的理解山羊lncRNAs的調(diào)控功能以及注釋山羊基因組，提供了一種有用的資源，也有助于更好地理解哺乳動(dòng)物的骨骼肌發(fā)育。

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