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Nature:基因組“暗物質(zhì)”中也存在癌癥驅(qū)動突變

時間:2019/10/14閱讀:331
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深圳子科生物報道:近年來,癌癥驅(qū)動基因引起了廣泛的關(guān)注。不過,人們過去發(fā)現(xiàn)的驅(qū)動突變主要集中在蛋白質(zhì)編碼區(qū),而廣大的非編碼區(qū)仍被稱為癌癥基因組中的“暗物質(zhì)”。人們有意探索RNA剪接在癌癥中的作用,但由于snRNA重復(fù)性等挑戰(zhàn),從剪接體(spliceosome)的非編碼成分中發(fā)現(xiàn)與癌癥相關(guān)的改變也并非易事。

加拿大研究人員近日在人類癌癥基因組的非編碼區(qū)域中發(fā)現(xiàn)了一種新的癌癥驅(qū)動突變。這個名為U1-snRNA的突變?yōu)閹追N類型的癌癥(包括腦癌、肝癌和血液腫瘤)帶來了潛在的治療靶點,有助于研究人員開發(fā)新的治療方法。他們就這一成果在《Nature》雜志上發(fā)表了兩篇論文。

這項研究的負(fù)責(zé)人之一、安大略癌癥研究所的Lincoln Stein博士表示:“非編碼RNA占了基因組的98%,但它出了名地難研究,而且它不編碼蛋白質(zhì),因此往往被人們所忽視。通過深入分析這些區(qū)域,我們發(fā)現(xiàn)了一個DNA堿基的改變,它可以引發(fā)多種類型的癌癥。反過來,我們又發(fā)現(xiàn)了一種新的癌癥機制,可針對它來治療疾病。”

在篇論文中,研究人員報道稱大約50%的Sonic hedgehog髓母細(xì)胞瘤(Shh-MB)中存在U1-snRNA的熱點突變,而其他亞型的髓母細(xì)胞瘤均不存在。此外,這種突變基本不存在于嬰兒病例中,主要發(fā)生在成年人(Shhδ)和青少年(Shhα)中。

他們發(fā)現(xiàn),U1-snRNA突變發(fā)生在5'剪接位點的結(jié)合區(qū)域,明顯破壞RNA剪接。突變分子介導(dǎo)的可變剪接使腫瘤抑制基因(PTCH1)失活,并使癌基因(GLI2、CCND2)激活。這種分子機制有望成為癌癥治療的新靶點。研究人員希望重新利用現(xiàn)有藥物,通過繞過藥物開發(fā)的早期階段,更快地將其引入臨床。

多倫多病童醫(yī)院的小兒神經(jīng)外科醫(yī)生、發(fā)育和干細(xì)胞領(lǐng)域的資深科學(xué)家Michael Taylor表示:“我們意外發(fā)現(xiàn)了一種全新的治療方法,能夠?qū)Ω哆@些很難治療且死亡率高的癌癥。DNA堿基中的一個錯誤引發(fā)了含有數(shù)百種突變蛋白的癌癥,我們可利用當(dāng)前的免疫療法來靶向這些突變蛋白。”

在第二篇論文中,多倫多大學(xué)Lincoln Stein教授領(lǐng)導(dǎo)的團隊又在肝細(xì)胞癌(HCC)和慢性淋巴細(xì)胞性白血病(CLL)的患者身上發(fā)現(xiàn)了U1-snRNA突變。U1的主要功能是通過堿基配對識別5’剪接點,而此突變將優(yōu)先的A-U配對更改為C-G配對,從而形成新的剪接點,并改變了多個基因的剪接模式。

研究人員表示,這項研究證明了剪接體RNA中存在非編碼驅(qū)動突變,也揭示了癌癥中異常剪接的新機制,可能代表了新的治療靶點。同時,他們還認(rèn)為,驅(qū)動突變的探索應(yīng)當(dāng)擴展到更廣泛的基因組區(qū)域。

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