深圳子科生物報道:近日,中國科學院昆明動物研究所孔慶鵬課題組研究發現裸鼴鼠的抗癌特性與長鏈非編碼RNA密切相關,相關成果發表在《表觀遺傳學與染色質》期刊上。
據了解,裸鼴鼠是嚙齒類動物中名副其實的長壽之星,其壽命可長達30年,而一般小鼠及大鼠的壽命僅有2~3年。此外,裸鼴鼠還具有天然的抗癌特性,因此裸鼴鼠在長壽和腫瘤研究領域受到極其廣泛的關注。長鏈非編碼RNA(LncRNA)被定義為長度大于200bp而不具備編碼蛋白潛能的轉錄本,過去認為lncRNA只是基因組中的junk DNA,如今發現lncRNA不僅能調控發育和基因表達,更是與諸多老年疾?。ㄈ缋夏臧V呆、腫瘤等)的發生息息相關。
以往,由于技術的限制以及lncRNA序列在物種間呈現低保守性等原因,lncRNA的鑒定和分析都存在較多的困難。然而,二代測序技術以及生物信息學的快速發展使得科研人員可以快速、準確地挖掘不同物種的lncRNA序列,并對其功能進行有效的預測。
孔慶鵬課題組以裸鼴鼠為研究對象,建立了一套嚴格的lncRNA鑒定流程,從裸鼴鼠基因組中成功鑒定出4422條高質量lncRNA,并發現裸鼴鼠的lncRNA具有表達豐度低、組織特異性強及保守性低等特點;通過共表達分析對裸鼴鼠的lncRNA功能進行預測,發現大約61.93%的裸鼴鼠lncRNA與抑癌基因表達高度相關。
科研人員進一步分析發現,裸鼴鼠的lncRNA與透明質酸相關基因存在較高的共表達關系,而透明質酸已被證實是裸鼴鼠具備抗癌特性的關鍵物質。該結果提示,裸鼴鼠的lncRNA可能通過調控透明質酸的生成,使得其擁有天然的抗癌特性。