化糞池是地埋式污水處理設備非常重要的一部分，然而化糞池中的雜質比較多，因此要正確管理地埋式污水處理設備的化糞池：
(1)水量控制：化糞池瞬時流量不宜過大，過大的水量會稀釋池內糞便等固體有 機物，縮短了固體有機物的厭氧消化時間，會降低化糞池的處理效果；且大水量易帶走懸浮固體，造成管道堵塞。
(2)防漏檢查：應定期檢查化糞池的防滲設施，以免糞液滲漏污染地下水和周邊環境。
(3)防臭檢查：化糞池的密封性也應進行定期檢查，要注意化糞池的池蓋是否蓋好，避免池內惡臭氣體溢出污染周邊空氣。
(4)清理格柵雜物：若化糞池安置有格柵時，應注意檢查格柵，發現有大 量雜物時應及時的清理，防止格柵堵塞。
(5)清理池渣：化糞池建成投入使用初期，可不進行污泥和池渣的清理，運行1-3年后，可采用的槽罐車，對化糞池池渣每年清抽一次。
(6)在清渣或取糞水時，不得在池邊點燈、吸煙等，以防糞便發酵產生的沼氣遇火爆炸；
(7)檢查或清理池渣后，井蓋要蓋好，以免對人畜造成危害。
除了以上正確管理地埋式污水處理設備的化糞池的方法之外，還要采取措施防止化糞池發出異味以及化糞池被阻塞。
