小流量紫外線消毒器的殺菌原理是利用紫外線燈管輻照強度，即紫外線殺菌燈所發出之輻照強度，與被照消毒物的距離成反比。當輻照強度一定時，被照消毒物停留時間愈久，離殺菌燈管愈近，其殺菌效果愈好，反之愈差。
小流量紫外線消毒器的選擇條件：
1、選用率的UV-C(LL或LH)紫外燈
2、選用*的低壓高強度紫外線燈管，燈管使用壽命保證在8000-12000小時以上。
3、選用高透光率、高純度的石英套管，保證紫外線透過在90%以上。
4、選用*的恒定、高強度紫外線鎮流器，能保證整個系統在復雜的情況下正常運行。
5、根據水質要求選用不銹鋼作反應器（304或316材質）、反應器內壁進行特殊拋光處理，以提高殺菌效果。
小流量紫外線消毒器具有殺菌速度快，效果好，不增加水的嗅味和改變水的物理性質，不產生致癌的三氯甲烷，操作簡便等特點，筒體采用食品衛生級的304不銹鋼制成，耐高壓，無金屬離子污染等優良特征。
小流量紫外線消毒器應用于一體化雨水收集回用設備中，處理水快速無雜質。他是通過紫外線照射完成消毒，破壞水中DNA中的結構，使細菌當場死亡不會再繁殖，從而帶到消毒效果。
