總的來說，醫藥純化水設備的制水方式不外乎有三種，除卻這三種之外，其他的所有制水方式都是在這上面衍生出來的，下面就介紹一下這三種醫藥純化水設備的制取方式及優缺點：
1、一種主要就是采用離子交換樹脂的方法，它的優點就在于初投資少，占地也比較少，缺點就是需要長期進行離子再生，不僅要耗費大量酸堿，而且對環境有一定的破壞。
2、第二種主要就是采用反滲透的方法來進行預處理然后再配上離子交換設備，它的特點為投入會比比采用離子交換樹脂方式要高，離子再生的周期相較于前一種要長，耗費的酸堿比單純采用離子樹脂的方式要少很多。對環境的破壞性要小得多。
3、第三種方法就是采用反滲透作預處理然后在加上電去離子也就是EDI裝置，這是目前制取純化水經濟，也是環保的純化水制取工藝，不需要進行酸堿再生便可連續制取純化水，對環境沒破壞性。其缺點在于初投資相對以上兩種方式過于昂貴。
醫藥純化水設備的制水標準一直都很高也很嚴格，需要達到15兆歐，符合醫藥用水的要求。并且為了產水不被污染，更是設置了各種關卡，在終用水點設置紫外線殺菌裝置也成為了常態，其殺菌率可以接近。以保證出水水質。
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