純化水系統設計時，會單獨設置可編程邏輯控制器(PLC)作為控制系統，它的作用是對回路的運行狀況進行控制，使之能夠正確運行。PLC控制系統擁有一套獨立的電器控制系統，將控制面板直接安裝在儲存及分配系統支架上的不銹鋼控制柜內，控制柜包括電器設備、可編程邏輯控制器和操作人員界面終端(OIT)。
在設計上，該系統便于操作人員對用水設備進行操作、監控和控制。通過操作人員界面終端，可以直觀了解設備操作參數，比如報警、行動、滅菌步驟、工藝設定點、工藝數值等信息一目了然。
那么，PLC控制系統是如何進行自動化控制的呢？例如，當純化水系統運行一個周期后，可以啟動消毒程序對整個系統進行滅菌，此時，系統通過傳感器把溫度或者臭氧濃度信號反饋給PLC控制系統，使其維持在某設定溫度或者濃度，并按照設定的消毒時間運行。
圖一 凈得瑞純化水設備(左邊的裝置為控制柜)
除此之外，PLC控制系統可實現自動化控制，包括以下的功能：
①對回水流量進行監控，并以其為依據對輸送泵進行變頻控制，當系統處于低液位狀態時將及時停泵，報警保護，降低系統的安全風險。
②對系統水溫進行控制，自動控制和調節系統交換器的加熱、冷卻，使得系統溫度維持在設定范圍內。
③對關鍵參數進行參數設定，自動監控和記錄分配系統的回水溫度、壓力、電導率等參數，可查看歷史記錄和運行趨勢，具有超限報警功能。
④實現生產和滅菌操作的自動化控制，可在線記錄和打印。當系統滅菌開始時，自動計時。
⑤自動控制儲罐液位，并具有報警功能。
⑥系統設有操作員、管理員、高級管理員三級管理權限，每一級設有不同的用戶名和密碼，防止未經授權進入系統，修改系統數據。
⑦可采用觸摸屏和上位機進行控制。
⑧觸摸屏上有系統流程界面、工藝及參數設定界面、歷史數據查詢。
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