清洗全自動發酵罐時，請用軟毛刷進行刷洗，不要用硬器刮擦，以免損傷發酵罐表面。電器、儀表、傳感器等電氣設備嚴禁直接與水、汽接觸，防止受潮。經常檢查減速器油位，如潤滑油不夠，需及時增加。
配套儀表應每年校驗一次，以確保正常使用。在發酵過程中，罐壓應維持在0.03～0.05MPa之間，以免引起污染。定期更換減速器潤滑油，以延長其使用壽命。
設備停止使用時，應及時清洗干凈，排盡發酵罐及各管道中的余水；松開發酵罐罐蓋及手孔螺絲，防止密封圈產生變形。
精密過濾器，一般使用期限為半年。如果過濾阻力太大或失去過濾能力致影響正常生產，則需清洗或更換，建議直接更換，不作清洗，因清洗操作后不能可靠保證過濾器的性能。
操作平臺、恒溫水箱等碳鋼設備應定期刷油漆，防止銹蝕。如果發酵罐暫時不用，則需對發酵罐進行空消，并排盡罐內及各管道內的余水。
全自動發酵罐的注意事項：必須確保所有單件設備能正常運行時使用本系統。在發酵過程中，應確保罐壓不超過0.17MPa。在空消、實消結束后冷卻過程中，嚴禁發酵罐內產生負壓，以免造成污染，甚至損壞設備。
在消毒過濾器時，流經空氣過濾器的蒸汽壓力不得超過0.17MPa，否則過濾器濾芯會被損壞，失去過濾能力。在實消過程中，夾套通蒸汽預熱時，必須控制進汽壓力在設備的工作壓力范圍內，否則會引起發酵罐的損壞。
在空消及實消時，一定要排盡發酵罐夾套內的余水。否則可能會導致發酵罐內筒體壓扁，造成設備損壞；在實消時，還會造成冷凝水過多導致培養液被稀釋，從而無法達到工藝要求。
在各操作過程中，必須保持空氣管道中的壓力大于發酵罐的罐壓，否則會引起發酵罐中的液體倒流進入過濾器中，堵塞過濾器濾芯或使過濾器失效。
