醫院污水特別是方艙醫院污水其污水水質性質和生活污水差不多，不同就是污水內可能菌群超標，需要在污水處理設備末尾的消毒工藝上適當延長污水消毒時間，醫院廢水處理設備運行模式為全自動運行模式，可以去除污水當中的COD、BOD、氨氮、大腸桿菌等污染物。
為達到中出水水質要求，本污水處理工藝包含預處理（格柵、調節池）、二級處理（生化+MBR池）、消毒等環節。
加強處理效果的一級強化處理適用于處理出水進入二級處理城市污水處理廠的綜合醫院。二級處理工藝適用于傳染病醫院(包括帶傳染病房的綜合醫院)和排入自然水體的綜合醫院污水處理。
醫院廢水處理設備原則：
1.全過程控制原則。對醫院污水產生、處理、排放的全過程進行控制。
2.減量化原則。嚴格醫院內部衛生安全管理體系，在污水和污物發生源處進行嚴格控制和分離，醫院內生活污水與病區污水分別收集，即源頭控制、清污分流。嚴禁將醫院的污水和污物隨意棄置排入下水道。
3.就地處理原則。為防止醫院污水輸送過程中的污染與危害，在醫院必須就地處理。
4.分類指導原則。根據醫院性質、規模、污水排放去向和地區差異對醫院污水處理進行分類指導。
5.達標與風險控制相結合原則。考慮綜合性醫院和傳染病醫院污水達標排放的基本要求，同時加強風險控制意識，從工藝技術、工程建設和監督管理等方面提高應對突發性事件的能力。
6.生態安全原則。有效去除污水中有毒有害物質，減少處理過程中消毒副產物產生和控制出水中過高余氯，保護生態環境安全。
