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?定量PCR實驗過程注意事項

2023-9-25  閱讀(403)

       在定量PCR(也稱rt-PCR或qPCR)中,熒光信號是由熒光探針或熒光DNA結(jié)合染料(如SYBR Green)產(chǎn)生,其強度與PCR產(chǎn)物分子(擴增子)的數(shù)量成正比。每個循環(huán)結(jié)束時,收集熒光信號強度,通過將熒光強度與循環(huán)數(shù)作圖,qPCR儀生成擴增曲線,其表示在整個PCR過程中產(chǎn)物的累積,通過這個過程,即可實現(xiàn)量化。如果樣品中特定的序列(DNA或RNA)豐富,則在較早的循環(huán)中觀察到擴增,Ct值小;如果序列稀少,則在稍后的循環(huán)中觀察到擴增,Ct值大。SOP將涵蓋總RNA提取和兩步法逆轉(zhuǎn)錄定量PCR(qRT PCR)的操作過程以及數(shù)據(jù)分析。

注意事項:

1、 所有步驟均應在超凈工作臺上進行,超凈臺紫外照射至少15min。

2、所有試劑應為此實驗專用。

3、使用75%乙醇或其他去污劑擦拭工作臺,避免表面污染。

4、 進入熒光定量PCR 操作實驗室后需要佩戴一次性無菌口罩、無菌乳膠手套、實驗中盡量避免與同事交談,防止PCR 模板污染。

5、實驗中使用各種規(guī)格的離心管,槍頭及配制試劑和溶解沉淀用的水,均應焦碳酸二乙酯(DEPC)處理后使用,以去除吸附的RNA酶污染。

6、 使用Trizol試劑時,避免接觸皮膚或衣服。避免吸入蒸氣。

7、qPCR反應需要qPCR級水,試劑和試管。請務必使用正確類型的qPCR光學PCR管和蓋子。不可用普通的PCR管。

8、加樣前,先布局,規(guī)劃加樣順序以避免交叉污染。

9、所有實驗應均應設置無模板對照,其中包含除DNA或cDNA樣品以外的所有反應組分。

10、先配制qPCR反應混合液,減少誤差。

11、 加樣后上機前,務必通過瞬離將反應液離至管底,并消除溶液中的氣泡,因為氣泡會干擾熒光檢測且降低酶活性,從而降低擴增效率。




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