化糞池在生活污廢水處理過程中可視為污染物初級處理系統，其原理是沉淀和厭氧微生物發酵。生活污水中比重大的顆粒物質沉降（形成沉渣），比重小的物質上浮（形 成浮渣）；利用微生物厭氧發酵作用使糞便等有機物被初步降解，實現污水的初級處理。生產污水處理設備成套生產污水處理設備成套

污水在化糞池內逐漸分離為3層：浮渣層、中間層和泥渣層。比重輕的物質（油類） 或夾帶氣泡的絮團向上懸浮，形成浮渣層；比重較大的固體沉淀在底層，形成泥渣層； 中間層是液體，在兼性厭氧菌和厭氧菌共同作用下，液體中的污染物質被分解，產生CH4、 CO2和H2S等氣體。上層浮渣和底層沉渣需定期清理，清掏出的泥渣經適當處理后可以 作為肥料。

化糞池采用隔墻或隔板進行間隔，構成多格化糞池，相關研究發現多格化糞池的處理效果要好于單格化糞池。 目前戶廁化糞池應用較為廣泛的是三格化糞池。污水首*入到格（池），池內糞便等物質開始發酵分解，因進入物質的比重不同，池內開始自然分層。經過一段時間的發酵和靜置分離，中層液體含蟲卵、病原體的大顆粒物質有所減少；污水經過連接管進入到格（池），沉渣和浮渣物質則被截留在（池） 內繼續分解。流入到格（池）的中層液體進一步發酵和進行固液分離，污水中的大 顆粒物質較（池）顯著減少；格（池）的中層液體后進入到格（池）主要起儲存、沉淀作用，此時液體基本腐熟，病原菌、蟲卵得到有效去除。