由于高速離心機的轉動慣性較大，其啟動電流大，持續時間較長，故電氣設備及線路應能承載較大的負荷，不要超過離心機銘牌或說明書中的轉速和固體密度，在機器安裝未牢固前，不允許操作離心機，啟動前，應擰緊機蓋壓緊螺栓及皮帶罩固定螺栓。
操作時，如有明顯異常和振動，應立即停機檢查，旋轉部件如轉鼓，螺旋推料器在維修時需要焊接，打磨時需與原生產廠家聯系。
高速離心機進行固液分離的話，是通過螺旋交叉和合適速度，來進行和實現的，而這一種離心機用來處理蛋白污泥的話，其出料口出現堵料現象的離心機判斷，是看離心機中電流是否過高，如果有的話，則說明存在該問題，要及時處理解決，不能拖延。
高速離心機操作安全防護的五個要點：
1、圍場操作：圍場操作是把感染性物質局限在一個盡可能小的空間(例如生物安全柜)內進行操作，使之不與人體直接接觸，并與開放之空氣隔離，避免人的暴露。實驗室也是圍場，是第二道防線，可起到“雙重保護”作用。圍場大小要適宜，以達到既保證安全又經濟合理的目的。目前，進行圍場操作的設施設備往往組合應用了機械、氣幕、負壓等多種防護原理。
2、屏障隔離：氣溶膠一旦產生并突破圍場，要靠各種屏障防止其擴散，因此也可以視為第二層圍場。例如，生物安全實驗室圍護結構及其緩沖室或通道，能防止氣溶膠進一步擴散，保護環境和公眾健康。例如，BSL-3實驗室核心區和半污染區之間的緩沖間則把操作感染性材料的核心區圍場在盡可能小的范圍內。按國家標準《實驗室生物安全通用要求》(GBl9489-2004)的要求，進出核心實驗室的緩沖間是必需的設置。
3、定向氣流：對生物安全三級以上實驗室的要求是保持定向氣流。其要求包括：
1)實驗室周圍的空氣應向實驗室內流動?以杜絕污染空氣向外擴散的可能，保證不危及公眾；
2)在實驗室內部，清潔區的空氣應向操作區流動，保證沒有逆流，以減少工作人員暴露的機會；
3)輕污染區的空氣應向污染嚴重的區域流動。
4、有效消毒滅菌：實驗室生物安全的各個環節都少不了消毒技術的應用，實驗室的消毒主要包括空氣、表面、儀器、廢物、廢水等的消毒滅菌。在應用中應注意根據生物因子的特性和消毒對象進行有針對性的選擇。并應注意環境條件對消毒效果的影響。凡此種種，都應在操作規程中有詳細規定。
5、有效攔截：是指生物安全實驗室內的空氣在排人大氣之前，必須通過粒子空氣(HEPA)過濾器過濾，將其中感染性顆粒阻攔在濾材上。這種方法簡單、有效、經濟實用。HEPA濾器的濾材是多層、網格交錯排列的，因此其攔截感染性氣溶膠顆粒。
