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如何利用在線資源研究癌癥基因組

時間:2012-3-8閱讀:502
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 癌癥基因組研究無疑已成為癌癥研究領(lǐng)域的一大熱點,而且這種研究技術(shù)無需研究人員十分扎實的生物信息學(xué)基礎(chǔ),就能獲得*——癌癥研究人員已經(jīng)積累了不少小突變,拷貝數(shù)變異,表觀遺傳學(xué)變化,表達水平差異的分析數(shù)據(jù),以及大量癌癥類型的臨床特征數(shù)據(jù),早在2008年科學(xué)家們就公布了*癌癥基因組序列(急性髓細胞白血病)。

這意味著目前進入這一領(lǐng)域研究的相關(guān)科研人員將能獲得更多,更高質(zhì)量的信息,當然研究分析不是一件容易的事情,正如Dana Farber癌癥研究所的副教授William Hahn所說的那樣,“要想了解這些信息,并掌握如何運用的方法,是一個巨大的挑戰(zhàn)。”
近期生命科學(xué)期刊The Scientist雜志以“Combing the Cancer Genome”為題,介紹了癌癥基因組研究中一些有效的在線資源,以及如何運用,可謂是這方面研究的指引手冊。
文章指出,目前可獲取的基因組數(shù)據(jù)來自幾個大型合作組織,癌癥基因組圖譜研究計劃(Cancer Genome Atlas pilot program,TCGA)就是其中一項,這是一項由美國國立癌癥研究所和美國國家人類基因組研究合作進行的項目,于2005年晚期啟動,目標是“測試一種大規(guī)模、系統(tǒng)性分析癌細胞基因組變化的方法的可行性”,為檢測、治療、預(yù)防癌癥提供基因組信息。
 

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