據了解，蝙蝠是夜行性動物。食蟲蝙蝠主要用回聲定位來確定方位、捕捉昆蟲，其眼睛退化；而生活在熱帶地區的舊大陸果蝠沒有回聲定位能力，它們主要依賴視覺和嗅覺來尋找食物，其眼睛很發達。
 
該所副研究員沈永義告訴《中國科學報》記者，此前，他在中科院院士張亞平的指導下，克隆了視網膜上視桿細胞中控制感光的視紫紅質的RHO基因，發現無論是眼睛退化的食蟲蝙蝠還是眼睛發達的舊大陸果蝠的視桿細胞都有表達RHO基因。這說明即使是那些眼睛高度退化的食蟲蝙蝠，仍然具有暗視覺。而且，該基因在果蝠與墓蝠（食蟲蝙蝠，眼睛沒退化）間發生了趨同進化，長翼蝠和菊頭蝠（眼睛都退化）也發生了趨同進化。
 
該結果揭示了在蝙蝠分化后，可能由于對暗視覺的趨同需求（有些種類趨向于更多地依賴視覺，眼睛發達；而有些趨向于較少依賴視覺，眼睛退化），導致了RHO基因在蝙蝠里面發生了多次趨同進化。
 
考慮到RHO只是暗視覺通路里面的一個基因，而暗視覺需要多個基因起作用，因此，沈永義等又研究了暗視覺通路上游的CRX基因和下游的SAG基因。結果發現，這兩個基因也在墓蝠和果蝠中發生了趨同進化。
 
沈永義告訴《中國科學報》，有意思的是，在對蝙蝠回聲定位的研究上，他們也發現這種復雜功能的趨同進化是多基因作用的結果。“這些研究表明，復雜的性狀是由多基因聯合控制的結果，這對進一步研究復雜性狀的起源和進化具有重要意義。”