下文所述的顯微鏡各自以不同的方式創建其圖像。常用的顯微鏡??是光學顯微鏡，它使用我們看到的光穿過樣品并產生圖像。實驗室常用顯微鏡
5種顯微鏡使用不同的技術創建圖像：
1.光學顯微鏡
2.共聚焦顯微鏡
3.掃描電子顯微鏡（SEM）
4.氦離子顯微鏡
5.X射線顯微鏡
光學顯微鏡
光學顯微鏡使用光創建您看到的圖像。這些顯微鏡用于家庭，學校，醫院實驗室以及制造工廠。光學顯微鏡的放大倍數受到光的光學特性的限制。光學顯微鏡包括用于研究固定樣品的立式復合顯微鏡，用于觀察細胞培養物或活細胞的倒置顯微鏡，用于生成3D圖像并查看小零件的立體顯微鏡以及由于透鏡的數值孔徑較大而提供更高分辨率的變焦顯微鏡。
共聚焦顯微鏡
與上述光學顯微鏡不同，共聚焦顯微鏡使用激光作為光源。激光使用不同的圖案掃描樣品，然后將圖像與計算機組裝在一起。激光可以比燈泡發出的光更深地穿透樣品。生成的圖像是可控景深的三維圖像。共聚焦顯微鏡使您可以通過堆疊來自不同光學平面的多個圖像來檢查細胞，模型生物和組織的內部結構。共聚焦顯微鏡還可以用于質量保證和控制中的表面分析。
掃描電子顯微鏡（SEM）
電子顯微鏡使用電子而不是可見光來創建圖像。為了使用電子顯微鏡，必須聚焦電子束，并且需要真空。光束被發送到樣品上，反彈并產生表面的三維圖像。電子的波長比燈泡或激光器發出的光的波長小得多，因此分辨率更高。當您想使用掃描電子顯微鏡時，您的樣品必須具有導電性，因此電子會從其反射回來。掃描電子顯微鏡所用的樣品通常涂有金或其他金屬的薄層。
氦離子顯微鏡
氦離子顯微鏡與掃描電子顯微鏡的相似之處在于成像技術基于掃描氦離子束。顯微鏡允許將樣品的銑削和切割結合在一起，并在亞納米分辨率下進行觀察。在成像方面，氦離子顯微鏡比掃描電子顯微鏡具有多個優勢。由于非常高的源亮度和氦離子的短波長，因此可以獲得使用光子或電子作為發射源的常規顯微鏡無法獲得的定性數據。由于氦離子束與樣品相互作用，因此不受大激發量的影響，因此可以在各種材料上提供具有大景深的清晰圖像。
X射線顯微鏡
X射線顯微鏡使用電磁輻射（X射線）生成微小物體的圖像。與掃描電子顯微鏡不同，X射線顯微鏡可用于生成活細胞的圖像。X射線比可見光更容易穿透樣品深度。X射線顯微鏡可以無損地鏡像樣本的內部，并以更高的空間分辨率創建物體內部結構的三維圖像。
