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需要高生產率高性能的蛋白質組分析
高性能2D Micro-HPLC系統可進行復雜肽組分的分離，其靈敏度和分離度都可超過目前的要求。將一維中的陽離子交換色譜與二維中的毛細管反相色譜進行結合，并利用6個捕集柱，可獨立優化不同的分析條件。這也使大量消化物中痕量肽的分離分析成為可能，因此可作為具有低顯示水平的未知蛋白質探索的極為有效工具。配置了電噴霧離子源接口（ESI）的質譜儀具有的性能及靈敏度。
特征
1. 在二維凝膠電泳中不能分析的蛋白質在此儀器中可進行分析。
高離子蛋白和疏水性蛋白質可在線分析。
2. 低顯示水平的蛋白質可進行高分離度和高靈敏度的自動分析。
蛋白質消化物可置于自動采樣器中進行自動分析。其靈敏度可滿足痕量肽分析要求，而在2-D凝膠中是不可檢測的。
3. 在線樣品捕集和隨后RPHPLC進行的自動化脫鹽可確保穩定的分析。
陽離子交換柱中的樣品在6個迷你捕集柱中捕集（反相柱中的聚合物的保留力等同于C4）并伴隨后續的反相分離進行脫鹽。此方法確保了穩定高精準分析。
分析實例
此分析結果為6種蛋白質（1 pmol）混合物消化的分析結果，如下圖3所示。 為了對比區分，最上面的色譜圖為1D LC-MS的分析結果，端交疊的色譜是二維分析中反相LC-MS的分析結果。在一維分析中對每一種蛋白質的分析。從中可見，運用此系統可大大改進肽的分離度水平。
初級洗脫使用的鹽是硫酸銨。每一個消化物的濃度分別為1mM, 10 mM, 20 mM, 30 mM, 50 mM和 99 mM。
根據美國國立衛生研究所，美國心理健康研究所與島津達成的CRADA協議，島津公司一直致力于參與蛋白質組分析的多維HPLC系統的聯合研發過程。
CRADA:
合作研發協議（是一個的聯合研究項目，通常由美國衛生與人力服務部下屬的科研機構，一個公司和其他的科研機構共同完成）
NIMH:
美國心理健康研究所
