zui大規模癌癥基因組研究

來自上海雙博生物科技有限公司的消息，癌癥基因組圖譜研究（Cancer Genome Atlas，TCGA）項目組公布了一項癌癥基因組zui大規模研究結果，研究人員在多個基因組技術平臺上分析了超過3500個腫瘤，從中發現了一種能區分癌癥的新方法。

2007年，美國國立衛生研究院NIH宣布進行為期兩年、總值340萬美元的癌癥基因組圖譜研究計劃（Cancer Genome Atlas pilot program），這一計劃目標是“測試一種大規模、系統性分析癌細胞基因組變化的方法的可行性”，為檢測、治療、預防癌癥提供基因組信息。

在過去的幾年里，這一項目陸續獲得了一些研究成果，而在這項研究中，研究人員采用6種不同的TCGA“平臺技術（platform technologies）”，分析了12種不同腫瘤類型樣品的DNA，RNA和蛋白，希望能從中發現不同類型的腫瘤如何相互區分。

研究結果表明相對于癌癥起源的組織類型，如乳房腎臟、膀胱等，相同癌癥起源的細胞類型具有更多分子和遺傳上的相似性。

我們組織中大部分是由許多不同類型的上皮細胞和非上皮細胞組成，“這項顛覆性的基因組研究不僅挑戰了基于組織類型的現有癌癥分類系統，而且還提供了能用于進一步研究的大量新數據來源，以及能用于區分每種新描述癌癥類型的分子特征整體列表，”研究人員說，“比如說膀胱癌能重新被分成幾種不同的癌癥類型，每一種都具有不同的臨床表征，這就有助于解釋對看似相同的癌癥類型進行相同的全身療法治療，為什么患者往往反應截然不同”。

這一研究組發現在十個癌癥患者中至少有一個能通過這種新系統分類到不同的癌癥類型中，而且Benz認為如果他們下一輪進行更多的樣品，和腫瘤類型的分析，將會有更多的腫瘤需要重新分類，他預計下一輪將進行超過20種不同腫瘤類型的分析。

在這項研究中，zui引人注目的發現就是膀胱癌和乳腺癌方面的成果，至少有三個不同亞型的膀胱癌需要重新分類：一種是無法與肺腺癌區分開來的亞型，一種是與起源自頭部，頸部和肺部的鱗狀上皮細胞癌很相似的亞型。

這項研究也指出和證實了乳腺癌類型中已知的差異，而且還揭示出了新的令人驚訝的發現——基底樣乳腺癌實際上是一類新癌癥類型。

基底樣乳腺癌（Basal-like breast cancers）通常稱為三陰性乳腺癌（triple-negative breast cancer），是一種特別具有侵襲性，并致命的癌癥。