近期的研究表明一些細胞使得有益細菌能夠安全地移居到新生兒的腸道中，但同時也抑制了他們的免疫系統使得他們更容易受到感染。孩子出生后的頭幾天是一個重要的發育時期，此時嬰兒的免疫系統必須適應許多新的刺激物。這其中包括在子宮中不存在、但會隨即移居到腸和皮膚等組織上的環境微生物。

    這一研究發現從根本上改變了我們對于新生兒容易發生感染的看法，表明它是由這一發育期間積極的免疫抑制所引起，而不是免疫細胞不成熟所致。這里的抑制細胞是成熟紅細胞的CD71+前體細胞。研究人員發現新生小鼠（和人類臍帶血）中富有CD71+前體細胞，在嬰兒適應他們充滿微生物的新世界時這些細胞阻止了過度活躍免疫反應。CD71+細胞表達一種叫做arginase-2的酶，后者對于免疫細胞抑制至關重要。研究人員說，這一過程通過阻止響應細菌移居出現強烈的炎癥，幫助了消化以及相關的功能。

    所謂轉座子，是指能拷貝并將其自身重新插入到基因組中的DNA片段，一項研究發現這種調控元件在懷孕期間能通過遷移，調控孕期相關基因的表達。研究人員也分析了類似短尾鼠的有袋動物，以及鴨嘴獸等單孔動物在內的卵生哺乳動物，此外這項研究也涉及一些非哺乳類物種，比如蜥蜴、雞和青蛙的轉錄組成果。當動物們開始生育下一代的時候，子宮中大多數基因都開始增加表達，并且相比于卵生動物，隨著胎盤的出現，胎生動物表現的更為明顯。一些在腸道和大腦中表達的基因也開始增加表達。

    研究人員進一步還發現很多古老的轉座子基因參與了孕激素結合位點相關的基因調控，這解釋了激素結合轉座子增多為何能促進懷孕期間大規模基因表達重組。研究發現, 母乳喂養可降低嬰兒患腹瀉和呼吸道感染等疾病的風險, 提高嬰兒的代謝功能和免疫能力。目前人們對母乳的關注多集中在其豐富的營養成分, 如蛋白質、脂肪酸、維生素和礦物質等。然而隨著實驗技術和新一代測序技術的發展, 人們發現母乳與人體其他部位一樣存在豐富的微生物菌群。