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Sanger酶法DNA序列分析

時間:2016/6/15閱讀:977
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一、試劑

1 、 10 × TBE ( pH 8.3 ):

2 、 46% 尿素溶液:

3 、 20% 聚丙烯酰胺溶液

4 、 10% 過硫酸胺

5 、引物

6 、模板

7 、 DNA 聚合酶

8 、放射性標記的 dNTP 和 ddNTP 貯存液

9、TEMED

二、操作方法

(一)由雙鏈質粒制備單鏈DNA膜板

取質粒 DNA (溶于雙離蒸去離子水中) 8μl ( 1.5 ~ 2ug )

加 2mol NaOH 2ul ,混勻后稍加離心,置室溫 10min

加 3mol 乙酸鈉( pH5.2 ) 3μl

雙蒸去離子水 7μl

無水乙醇 60μl

置液氮 10min ,離心 10min ( 13krpm ),

加 70%乙醇洗1次,離心 ( 13krpm )

棄上清,真空抽干,溶于 10ul雙 蒸去離子水中

取樣,電泳鑒定

(二)聚丙烯酰胺/尿素膠制備:

將玻板洗凈,拭干; 70% 乙醇洗,涼干;內層涂硅油,

重蒸水洗凈,吹干

混合: 20% 聚丙烯酰胺液 20ml

10 × TBE 5ml

46%尿素 25ml

總計40ml過濾紙濾過

加 10%過硫酸胺(AP)250μl;用雙蒸去離子水定容至100ml,混勻

倒膠前加入 TEMED 50μl,混勻

灌膠,待凝膠聚合后,將測序膠板安裝于測序電泳槽中

電泳槽中加入 800ml1 × TBE

預電泳

(三)DNA序列反應:

模板 DNA 10μl ; 4 只離心管上標記

引物 2μl G 、 A 、 T 、 G 各管中

退火緩沖液 2μl 分別加入 2.5ul 的 ddNTP

總體積 14μl 終止混合液,蓋好蓋子。

↓ ↓

60℃ 10min 變性 37℃孵育1min

↓ ↓

標記混合物 3μl

α-32P-dATP 1μl

稀釋的DNA聚合酶2μl

混勻后置室溫5min

每個反應管4.5μl ↓

↓--------------------------------

37℃ 5min溫浴

每管加入5μl 終止液

混勻,置冰上

上樣前75~80℃

混勻,置冰上

上樣前75℃~85℃加熱2min,隨即上樣

依次為A、G、C、T,每孔上樣2~3μl

40W恒功率下電泳,至溴酚藍走到底

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