RNAi所產(chǎn)生的基因沉默具有如下特點： 
1)性。Elbashir等在研究中發(fā)現(xiàn)分別為25 nmol/L與100 nmol/L的起始雙鏈RNA產(chǎn)生的結(jié)果是一樣的，只是高濃度起始的更有效些。將雙鏈RNA濃度降低到1.5 nmol/L時產(chǎn)生的基因沉默效果變化不大，只有當濃度降低到0.05 nmol/L時，沉默的效果才消失。Holen等也證實1～100 nmol/L的雙鏈RNA濃度對基因沉默的效果是一致的。這說明雙鏈RNA介導的基因沉默效率是相當高的。 
2)需要atp。 Zamore等認為RNAi過程中至少有2個步驟需要能量的供給：一是長的雙鏈RNA被 Dicer所酶切產(chǎn)生雙鏈RNA；二是在雙鏈RNA與RISC結(jié)合解鏈后形成有活性的RISC。 
3)特異性。Elbashir等和Brummel kamp等發(fā)現(xiàn)在21～23個堿基對中有1～2個堿基錯配會大大降低對靶mRNA的降解效果。 
4)位置效應。Holen等根據(jù)人 TF(tissue factor)不同的位置各合成了4組雙鏈RNA來檢測不同位置的雙鏈RNA對基因沉默效率的影響。在不同濃度和不同類型的細胞中，hTF167i和hTF372i能夠抑制85％～90％的基因活性，hTF562i只能抑制部分基因活性，而hTF478i則幾乎沒有抑制基因的活性。他們還以hTF167為中心依次相差3個堿基對在其左右各合成了幾組雙鏈RNA，有趣的是它們所能抑制該基因活性的能力以hTF167為中心依次遞減。特別是hTF158i和 hTF161i只與hTF167i相距9個和6個堿基，但它們幾乎沒有抑制該基因活性的能力。結(jié)果還表明雙鏈RNA對mRNA的結(jié)合部位有堿基偏好性，相對而言，GC含量較低的mRNA被沉默效果較好。 
5)競爭效應。Hoten等將10 nmol/L和30 nmol/L的hTF167i相比，兩者的沉默基因效果無差異，但將20 nmol/L基因抑制效果很差的PSK314i和10 nmol/L的hTF167i相混和后，hTF167i產(chǎn)生的抑制效果明顯降低。 
6)可傳播性。在線蟲中，雙鏈RNA可以從起始位置傳播到遠的地方，甚至于全身。Feinberg 和Hunter在線蟲細胞膜上發(fā)現(xiàn)一種跨膜蛋白SID1，它可以將雙鏈RNA轉(zhuǎn)運出細胞，因此系統(tǒng)性的RNAi包括了SID1介導的雙鏈 RNA在細胞間的運輸。但在果蠅上并未發(fā)現(xiàn)有此基因的同源物，因此在果蠅上通過注射產(chǎn)生的RNAi不能擴散。