預(yù)測小分子抗癌活性有了新算法

時間：2012-12-19閱讀：412

記者從中科院昆明動物研究所獲悉，該所李功華博士在研究員黃京飛的指導(dǎo)下，開發(fā)了一個新的基于分子藥效團(tuán)的小分子比對算法，并成功應(yīng)用于預(yù)測小分子的抗癌活性。近日，該研究發(fā)表在*計算生物學(xué)雜志《生物信息學(xué)》上。

據(jù)李功華介紹，開發(fā)新的抗癌藥物是科學(xué)界和醫(yī)學(xué)界的熱點(diǎn)和難點(diǎn)。直接采用實(shí)驗(yàn)的方法篩選抗癌藥物具有花費(fèi)大、時間長的特點(diǎn)。以小分子為例，現(xiàn)在已知的小分子化合物超過了1000萬個，因此，直接采用實(shí)驗(yàn)的方法從這1000萬個化合物中篩選藥物小分子幾乎是不可能的。因此，建立一個、可靠、準(zhǔn)確的抗癌藥物的計算生物學(xué)篩選系統(tǒng)對發(fā)掘新的抗癌藥物具有重要意義。

為建立抗癌藥物活性的計算生物學(xué)預(yù)測系統(tǒng)，李功華開發(fā)了一個新的基于分子藥效團(tuán)的小分子比對算法，通過交叉驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)其預(yù)測的線下面積達(dá)到了0.878，顯示該算法能很好地預(yù)測藥物小分子的抗癌活性。

同時，李功華還開發(fā)了一個簡便易用的預(yù)測抗癌藥物活性的網(wǎng)頁服務(wù)器，使該算法能被不同學(xué)科的研究者和醫(yī)藥工作者所應(yīng)用。

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