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新一代蛋白研究工具——抗體芯片(圖)
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- 【資料簡介】
蛋白組學研究是即基因組學研究后的生命科學發展的一個大方向之一。蛋白質的結構和功能zui終直接影響著生命活動的變化,基因轉錄水平的研究只能在一定程度上反映基因表達產物的變化,而真正發揮功能的蛋白要經過轉錄后加工、翻譯調控以及翻譯后加工等許多步驟和調控才能形成,因而對蛋白質的直接研究才能真實的解釋各種生命現象。但是目前研究蛋白質的手段和方法還沒有很大的發展,所以尋找有效、快捷的蛋白分析技術成為了至關重要的一個環節。
蛋白芯片技術的出現給蛋白組學研究帶來新思路。蛋白組學研究中一個主要的內容就是要研究在不同生理狀態或病理狀態下蛋白水平的量變,微型化,集成化,高通量化的抗體芯片就是一個非常好的研究工具,它也是蛋白芯片中發展zui快的芯片,而且在技術上已經日益成熟。這些抗體芯片有的已經在向臨床應用上發展,比如腫瘤標志物抗體芯片等,還有很多已經用在研究的各個領域里。
*張商品化的抗體芯片是由美國BD Clontech公司推出的。這是一張用于研究的抗體芯片,芯片上排列了378種已知蛋白的單抗(Ab Microarray 380,目錄號 K1847-1),這些單抗對應的蛋白都是細胞結構和功能上十分重要的蛋白,涉及信號傳導、腫瘤、細胞周期調控、細胞結構、細胞凋亡和神經生物學等廣泛的領域。通過這張芯片,我們在一次實驗中就能夠比較幾百種蛋白的表達變化。
Ab Microarray 380上抗體是經過精心挑選的,這些抗體不僅可以識別人源的蛋白,對小鼠和大鼠樣品同樣有效。另外,每個抗體的結合親和力都經過了實驗測定,從多種抗體來源的克隆中篩選出反應特異性好,交叉反應程度小,信號明顯的抗體,并且還要保證信號與抗原濃度有著良好的線性關系。優化的抗體探針才可以保證反應的特異和靈敏(可檢測20pg/ml的抗原濃度)。芯片的檢測是用熒光報告分子,常用的熒光掃描儀都能夠完成。
*代的蛋白芯片和DNA芯片一樣是作為一種定性分析的工具,可用于分析樣品之間相關蛋白的相對表達豐度;還可以作為DNA芯片的補充,用于研究蛋白和基因表達之間的關系。
操作流程
Ab Microarray 380抗體芯片并不要求特殊的實驗操作,只要一般常規的操作就可以完成以往極為復雜耗時的工作。整個操作流程包括:從50~200mg組織或細胞、體液中進行蛋白質抽提——用Cy5和Cy3兩種不同顏色的熒光分子分別標記兩個樣品——洗去多余的標記分子——與芯片雜交孵育——掃描分析結果。整個過程從樣品制備到結果分析只要一天即可完成,你只要準備好樣品、熒光染料、脫鹽純化柱(處理體液樣品時用)和熒光掃描儀,其他的試劑全部由試劑盒提供。
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