日韩欧美一区二区三区免费观看_精品国产欧美一区二区_波多野结衣乱码中文字幕_最新无码国产在线视频2021

齊一生物科技(上海)有限公司
免費會員

中國科學院開發完成基因排布網絡可視化工具LCGserver

時間:2015/8/26閱讀:370
分享:

基因在染色體上的排布(Gene Orders)是高度組織化的,在自然選擇作用下,單一基因的結構和成簇基因的排列順序在不同進化分支中具有不同程度的可變性,并且基因排布與染色體結構的關系仍然有待進一步探索。進化基因組學的重要研究內容之一就是揭示在這些大規模且不同程度的基因排布下,不同物種基因組在基因共調控機制方面的相似和差異。現今,二代測序技術的快速發展和廣泛應用,產生了不同分類群代表物種的基因組數據,但是缺乏一個基于大規?;蚪M數據且操作簡單的基因排布可視化工具。
為此,中國科學院北京基因組研究所基因組科學與信息重點實驗室研究員于軍和英國倫敦大學學院腫瘤研究所王大鵬合作開發了一套全新的網絡可視化工具LCGserver,用于解析多類群進化背景下基因排布的動態變化規律,此項研究于近期發表在OMICS: A Journal of Integrative Biology 雜志。
針對基因排布,LCGserver提供三個水平的分析功能:單個基因、成對基因和成簇基因。其*的功能是可以根據成組基因的同源性將不同的基因組進行比對,幫助用戶直觀地鑒定特定物種基因組在特定進化分支上基因排布的保守和變異事件。另外,根據保守和變異的所有可能性,將成對基因分成6種模式并且可以識別*保守的基因簇的存在。
此項研究將對進化和比較基因組學領域產生積極影響,比如研究新測序物種基因組和公共數據庫基因組的基因共線性關系,通過比較近緣物種基因組查看并糾正組裝過程中存在的問題,通過基因位置信息構建物種進化樹,與RNA-Seq數據結合進行基因位置和基因共表達的交叉驗證,高度保守的基因簇可以作為高維基因組結構的錨點等。

成對基因的六種變異模式

會員登錄

×

請輸入賬號

請輸入密碼

=

請輸驗證碼

收藏該商鋪

X
該信息已收藏!
標簽:
保存成功

(空格分隔,最多3個,單個標簽最多10個字符)

常用:

提示

X
您的留言已提交成功!我們將在第一時間回復您~
在線留言
主站蜘蛛池模板: 巴彦淖尔市| 富源县| 绥滨县| 阿克| 布拖县| 馆陶县| 扶沟县| 南通市| 金湖县| 三明市| 太和县| 湾仔区| 望江县| 岑溪市| 崇阳县| 乳源| 体育| 江孜县| 奉化市| 桃园市| 桂平市| 芦山县| 景洪市| 新闻| 洛南县| 阿尔山市| 西安市| 雷波县| 定陶县| 汉源县| 会泽县| 吴堡县| 邵阳市| 德庆县| 宿州市| 喀喇沁旗| 丽江市| 西林县| 千阳县| 韶关市| 黄大仙区|