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大規模測序發現癌癥風險基因齊一生物

時間:2016/8/19閱讀:248
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近期發表在《Lancet Oncology》上的研究表明,一些已知癌基因發生生殖系突變可能增加個人對肉瘤的易感性,肉瘤是一種罕見的骨組織和軟組織癌癥。
作為肉瘤家族研究(ISKS)的一部分,澳大利亞研究人員領導的一個小組對1000多名肉瘤患者進行了靶向基因panel測序。除了已知的與肉瘤相關的基因突變外,測序數據還揭示出,與其他癌癥類型相關的基因,例如TP53、ERCC2、ATR、BRCA2和ATM,出現了復發性突變。
研究人員發現,在這些接受檢測的患者中,超過一半的人攜帶有至少一個癌癥相關基因的突變,而且攜帶有多個癌癥相關基因的突變的患者發生早發性肉瘤的風險會增加,這類人占了檢測人群的1/5。
文章通訊作者、Kinghorn癌癥中心和Garvan醫學研究所癌癥部門主任DavidThomas說,“多種基因的影響相結合會增加肉瘤發生的風險,患者攜帶的突變越多,癌癥發生就越早。”
Thomas說,“以前我們無法判斷出這些具有患病風險的人群和家庭,但是現在我們可以更好地管理這種風險,并幫助這些人在需要的時候進行治療。”
Thomas和他的同事重點關注了72個潛在癌癥風險基因,對1162名15歲以上的肉瘤患者的血液或唾液樣本提取DNA,并進行靶向基因panel測序。約3/4的人是高加索人,其中約15%的人患有多原發性癌。
研究人員以來自三個大型研究(例如NHLBI的外顯子組計劃)的6500多名高加索人作為對照組發現,約55%的肉瘤患者出現了可疑的生殖系變異增加的情況,這些變異似乎是致病性的。突變多發生在TP53、BRCA2、ATM、ATR和ERCC2基因中。
除了這些癌癥風險的線索之外,Thomas表示,“引起癌癥風險增高的這些遺傳變異還可幫助我們了解,如何采用的方式治療癌癥。在我們的研究對象中,1/3的患者攜帶的基因突變給了我們重要的信息,告訴我們如何定期監測這些患者以及他們是否應該接受某種治療。”
例如,28名肉瘤患者發生BRCA1或BRCA2生殖系突變,影響ru腺癌和卵巢癌風險。約20多名患者的ERCC2基因發生罕見的致病性突變,ERCC2基因編碼的蛋白通常有助于減少化療相關毒性。
該研究小組計劃繼續擴大當前研究結果,對具有肉瘤風險的人群的生殖系樣本進行全基因組測序,目前研究已經啟動。
 
參考文獻:Monogenic and polygenic determinants of sarcoma risk: an international genetic study. DOI: 

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