一些對制造生物燃料感興趣的研究人員，希望能夠在不會太過影響木質素的情況下，從植物材料中除去這些糖類。
植物生物克隆了擬南芥中與纖維素、半纖維素以及木質素生成相關的50個基因，篩查了它們與460多個轉錄因子，或是開啟或關閉基因表達的其他一些基因的相互作用。
研究人員構建出了一個顯示不同的基因和轉錄因子如何彼此的網絡。這是次在一種植物中以這樣的水平闡明這樣的網絡。它有助于我們思考如何來操縱和控制這些網絡。
值得注意的是，這一網絡中包含大量的‘前饋回路’，舉一個前饋回路的例子，轉錄因子X作用于Y因子，后者轉而對Z基因起作用。而X也可以直接對Z起作用。這樣的系統在其他的控制網絡中已被人們所熟知，其可以在沒有*核心調控因子的情況下降低隨機“噪音”，精細協調不同的步驟。
研究人員還研究了這一系統對于不同類型的環境變化所做出的反應。例如，奪去根細胞的鐵離子可促進木質素生成，木質素可提高鐵攝取。但將細胞暴露于鹽中則可引起不同的反應：木質部細胞會發生增殖來增加水輸送。
了解影響木質素、纖維素和半纖維素含量的控制網絡，zui終有助于植物育種者們構建出于實現生物燃料生產的品種。