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當(dāng)前位置:上海逸峰生物科技有限公司>>公司動態(tài)>>Nature介紹癌癥研究新方法(一)
來自冷泉港實(shí)驗(yàn)室,德州大學(xué)MD安德森癌癥研究中心等處的研究人員提出了一種分析研究癌變腫瘤的新方法,并且研究人員還發(fā)現(xiàn)腫瘤可能并不是逐步演變的,而是間斷性發(fā)生的,這對于腫瘤發(fā)生,轉(zhuǎn)移研究具有重要的意義,也有助于臨床腫瘤診斷。這一研究成果公布在Nature在線版上。
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領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是冷泉港實(shí)驗(yàn)室遺傳學(xué)專家Michael Wigler教授,他曾揭示過自閉癥的遺傳機(jī)理,人類基因組的大范圍變異,以及乳腺癌分子機(jī)理等重要的疾病機(jī)理。
這種由冷泉港實(shí)驗(yàn)室開發(fā)的分析方法就是單細(xì)胞測序技術(shù)(single cell sequencing,SNS),這種方法能準(zhǔn)確定量一個(gè)單細(xì)胞核中基因拷貝數(shù)目。癌細(xì)胞中,基因組部分被刪除,或者擴(kuò)增,從而引起關(guān)鍵基因的缺失,或者表達(dá)過量,干擾正常細(xì)胞生長,因此利用這種方法就能分析基因拷貝數(shù)目,從而診斷癌癥。
Wigler教授認(rèn)為,“這項(xiàng)研究證明我們能通過對癌變腫瘤中的一個(gè)單細(xì)胞進(jìn)行測序,獲得的高通量拷貝數(shù)”,“檢查同一癌癥的多個(gè)細(xì)胞,我們就能了解這種癌癥是如何發(fā)生與擴(kuò)散的”。
癌癥異質(zhì)性的重要性
要想在分子水平上通過腫瘤生長特性來區(qū)分腫瘤的種類是一件非常困難的事情,這只能在臨床上分析實(shí)際患者才能得知。而基礎(chǔ)研究認(rèn)為癌癥是高度異質(zhì)化的,這也就是說某種類型的癌癥,比如說乳腺癌,或者肺癌,結(jié)腸癌,都是分屬于許多不同的癌癥亞類,研究人員已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了許多癌癥類型的*標(biāo)記。
在這篇文章中,研究人員首先準(zhǔn)備了兩個(gè)預(yù)知類型的癌癥樣品,這兩個(gè)樣品都屬于一種原發(fā)性侵入乳腺癌:所謂的三陰乳腺癌(triple-negative)類型——這種類型的乳腺癌侵襲性。其中一個(gè)樣品通過之前的分析,確定為多基因組型(polygenomic):由不同腫瘤細(xì)胞類型組成,其拷貝數(shù)目,基因組類型,以及變化過程通過傳統(tǒng)方法是無法進(jìn)行檢測的;另外一個(gè)樣品是單基因組型(monogenomic):由單個(gè)遺傳類型細(xì)胞組成,不同于前一個(gè)樣品,這個(gè)樣品已經(jīng)轉(zhuǎn)移到了肝臟,這些樣品都進(jìn)行了進(jìn)一步分析。
研究人員通過SNS分析方法——全基因組擴(kuò)增,以及新一代測序方法,發(fā)現(xiàn)事實(shí)上,這三種不同類型的腫瘤細(xì)胞亞群都是存在的,每個(gè)亞群都由高度相似的拷貝數(shù)目的細(xì)胞組成,研究人員認(rèn)為這很可能代表了腫瘤的三種不同克隆表達(dá)。
來源:生物通
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